Leider trat jedoch dort auch ein Umlautproblem auf: Alles wurde in Latin-1 gespeichert.
Nach langen Suchen und verzeifelten Drehen an allen möglichen Konfigurationen hab ich jetzt die Ursache gefunden: Ein Fehler im MySQL -Connector in der Version 3.1.16.
Version 3.1.17 behebt das Problem.
Die Fehlersuche war hierbei besonders nervig, da dieser Bug schonmal von MySQL behoben wurde und man deswegen eigentlich dachte, er würde da nicht mehr auftreten.